北大医学部医院技术强，是国内医学诊疗科研有重要基地。
北京大学医学部直属附属医院有：
北京大学第一医院
北京大学人民医院
北京大学第三医院
北京大学口腔医院
北京大学肿瘤医院
北京大学第六医院。
北京大学医学部与地方和企业共建医院有：
北京大学首钢医院
北京大学国际医院
北京大学海淀医院
北京大学深圳医院。
北京大学医学部以开展临床医学教学的医院有：
北京大学北京医院
北京大学西苑医院
北京大学地坛医院
北京大学积水潭医院
北京大学回龙观医院
北京大学中日友好医院
北京大学首都儿科研究所
北京大学航天临床医学院
北京大学三O二临床医学院。
以上医院，在医疗诊疗科研上都有成就。
北大医疗旗下医院
北大医疗以北京大学国际医院为核心拥有三家综合医院、六家专科连锁机构，加上2016年已确定合作的潞安集团总医院及枣矿集团所属四家医院，其床位规模已超过一万张。
北大医疗产业集团成立于2003年，是北京大学医学部重要的产学研平台，致力于“持续成为中国医疗体制改革和社会资本办医领跑者”。其依托北京大学医学部完善的医教研体系、专家资源和医院管理经验，建立了以北京大学国际医院为龙头，以覆盖全国的综合医院和专科医疗服务为主体，与健康保险、智慧医疗、养老产业、医药行业相互融合的产业生态，已拥有三家综合医院、六家专科医疗连锁机构，在健康管理、肿瘤筛查、专科医疗、康复医疗等领域提供“让患者满意，让医生发展”的优质服务。
