种质基因库是收集和长期保存植物体的一部分活组织 (包括种子)的保存库，种质基因库中保存的材料主要有种子、花粉、培养组织、一部分营养器官、DNA等。
保存种子的种质基因库又叫种子库，其保存条件涉及种子生理代谢的各种条件，可保存的时间长短依种类不同而异，一般保存在5℃ 或更低温度条件下，或保存含水量为5%～7%的种子于密闭容器中，或保存种子于相对湿度低于20%的条件下，亦可将种子保存在液态氮中(-196℃)。有生命活力的种子都要进行生理代谢，所以种子的保存时间还是有限的，需要定期进行检测，当种子的发芽率低于20%时，就需要更新种子。
基因库是一个群体中所有个体的全部基因的总和。有性生殖支撑了一种独特的基因库构建与运行模式，减数分裂通过修修补补、程序性突变（如复制错误、缺失、插入、重复等，这些与辐射诱变等比较，相对温和）等增加种群内基因的多样性以及等位基因的多态性，并分散保存于种群之中（种群规模越大，容纳潜力越大），这是一种高效而相对安全的物种基因库扩增方式。
种质库和基因库区别
种质库：
保护生物多样性的措施：
(1)就地保护：主要形式是建立自然保护区，是保护生物多样性最有效的措施。
(2)迁地保护：将濒危生物迁出原地，移入动物园、植物园、水族馆和濒危动物繁育中心，进行特殊的保护和管理，是对就地保护的补充。
(3)建立濒危物种种质库，保护珍贵的遗传资源。
(4)加强教育和法制管理，提高公民的环境保护意识。
基因库：
是一个群体中所有个体的全部基因的总和。
有性生殖支撑了一种独特的基因库构建与运行模式，减数分裂通过修修补补、程序性突变（如复制错误、缺失、插入、重复等，这些与辐射诱变等比较，相对温和）等增加种群内基因的多样性以及等位基因的多态性，并分散保存于种群之中（种群规模越大，容纳潜力越大），这是一种高效而相对安全的物种基因库扩增方式。
