显微镜放大倍数有两种概念，一种是光学放大倍数，一种是数码放大倍数（只有连接成像设备时才会涉及到数码放大倍数）。
光学放大倍数：是指我们从显微镜目镜中观测到物体被放大后的倍数。光学放大倍数的计算方式比较简单，即物镜倍数*目镜倍数。
数码放大倍数：数码放大是指外接设备后，显示到图像上的放大倍数，目前市场上较多的是用三目显微镜，通过CCD设备连接至电脑、监视器或者电视机上进行成像观察，以减轻眼睛的疲劳，同时也便于与他人分享。
显微镜的倍数是相对而言的，没有完全的低倍与高倍，一般显微镜，转换的是物镜，目镜一般不变，所以用10倍物镜如果是低倍则40倍物镜就是高倍，没有明确的界限，低倍镜倍数小，看到的细胞数目多，高倍镜倍数大，看到的细胞数目多，但视野较暗。 反而不清楚。
现在的教学实验室中的大多是光学显微镜，一般目镜为10倍和20倍，物镜有4倍、10倍、40倍、100倍(油镜)，放大倍数=目镜*物镜.所以，一般也就是40-2000倍.
