副主任职务为非领导职务副科级干部，“副科级干部”包括非领导职务副科级干部和领导职务副科级干部。新《公务员法》实施前，晋升为副主任有两种方式：一是按规定直接晋升，机关、单位规定不超过二分之一 “非领导职务” ，职位不得超过单位级别。如果是县级机关和单位，非领导职务可以是主任或副主任，但不能直接任命处级领导干部或研究人员。另一种方式是2015年实行“县级以下公务员职务与职级并行”制度。任职12年以上的科员，只要达到23级，就可以享受“副主任”科员的待遇。这种晋升制度只体现在工资待遇上，与职位晋升无关。通过这种 “并行” 晋升者，退休时仍按晋升前的职级退休。
2018年12月29日，全国人民代表大会常务委员会审议通过了《中华人民共和国公务员法（修订草案）》。新《公务员法》发布后，不再使用“非领导职务”，取而代之的是一至四级主任。无论以何种方式晋升副主任科员，都会被套改为四级主任科员，按任职年限晋升，最高可晋升为二级主任科员，享受正科级待遇。副科级实职干部虽然不参与套改工作，但晋升与副主任科员没有什么不同，也是从四级主任科员开始计算的。副主任科员和副科实职也算任职年限。
